4.1 Postupový diagram pro detekci a identifikaci R. solanacearum ve vodě
Obrázek - Postupový diagram
------------------------------------------------------------------
1) Viz. oddíl 4.2.1., kde jsou uvedeny doporučené postupy vzorkování.
2) Metody koncentrace patogenu jsou popsány v oddíle 4.2.1. Koncentrace zvětšuje populaci jak patogenu, tak konkurenčních saprofytických bakterií a doporučuje se jen tehdy, jestliže nebrání izolačnímu testu.
3) Selektivní izolační test je popsán v oddíle 6.1.4.
4) Biotest je popsán v oddíle 6.1.9.
5) Metody obohacovacího testu PCR jsou popsány v oddíle 6.1.4.2. a 6.1.6.
6) Metody obohacovacího testu ELISA jsou popsány v oddíle 6.1.4.2. a 6.1.8.
7) Typická morfologie kolonie je popsána v oddíle 2.3.d.
8) Kultivace může selhat z důvodu konkurence nebo inhibice saprofytickými bakteriemi. Je-li podezření, že velká saprofytická populace ovlivní spolehlivost izolace, opakují se izolační testy po zředění vzorku sterilní vodou.
9) Spolehlivá identifikace podezřelých čistých kultur R. solanacearum se dosáhne pomocí testů popsaných v oddíle 6.2.
10) Test patogenity je popsán v oddíle 6.3.