3. Auditní orgán
Ministerstvo financí České republiky - Odbor Auditní orgán - Centrální harmonizační jednotka bude provádět úkoly auditního orgánu. Ředitel odboru Auditního orgánu - Centrální harmonizační jednotka bude jednat jako zástupce kontrolního orgánu.
Ministerstvo financí je centrální orgán státní administrativy, Odbor Auditní orgán - Centrální harmonizační jednotka patří do Sekce 04 - Finanční, Auditní a Provozní podává zprávy náměstkovi ministra sekce 04.
Role a zodpovědnosti auditního orgánu jsou stanoveny v Postupech, zejména v jejich článku 4.6.
Auditní orgán bude funkčně nezávislý na Národním kontaktním místě a certifikačním orgánu.