Čl.32
Sekretariát plní zejména tyto úkoly:
a) sleduje provádění obchodní a celní politiky celní unie,
b) sleduje harmonizaci systémů používání státních vývozních podpor s cílem zabránit rozrušování hospodářské soutěže mezi subjekty obou Smluvních stran,
c) předkládá Radě návrhy výročních zpráv o plnění smlouvy o celní unii,
d) činí doporučení oběma Smluvním stranám, pokud jde o opatření, která mají vliv na zahraniční obchod,
e) koordinuje provádění celní statistiky ze systému sběru republikových dat a zajišťuje jejich vzájemnou výměnu,
f) zajišťuje po technické a organizační stránce činnost Rady a Rozhodčí komise,
g) sleduje vývoj celního zákonodárství, zejména v Evropských společenstvích,
h) sleduje celní zákonodárství Smluvních stran.